离心机按用途主要分为制备式和分析式离心机。制备式离心机主要用于对不同密度、不同形状的物质颗粒进行分离提纯；分析式离心机则主要用于观察、分析物质颗粒在离心时的运动状态，测定该物质颗粒的沉降系数、扩散系数和物质质量等，带有一套光学系统。
按转速则主要分为低速、高速及超速离心机。低速离心机的转速一般低于8000 r/min，多用于收集易沉降的大颗粒物质，如酵母细胞等；高速离心机的转速在8000～30000 r/min,多用于搜集微生物、细胞碎片、细胞、大的细胞器、硫酸沉淀物以及免疫沉淀物等，但不能有效沉淀病毒、小细胞器（如核糖体）蛋白质等大分子超速离心机则为转速大于30000 r/min的离心机,其主要用于分离细胞器、病毒、核酸、蛋白质、多糖甚至能分开分子大小接近的DNA等。此外，还有人将转速大于80000 r/min的离心机称为超高速离心机。
此外，按照控制温度不同，离心机可以分为冷冻离心机和普通离心机，冷冻离心机带有制冷系统，能够控制温度为-20℃。一般来说，普通离心机不带制冷系统。高速和超速离心机带有制冷系统和温控系统。
